依托北京航空航天大学在国内顶尖的计算机学科、电子信息工程及相关学科优势，软件学院于2002年4月正式成立，是教育部、国家计委批准的35所国家示范性软件学院之一，现担任全国软件工程领域工程硕士培养工作牵头单位。
软件学院通过吸引众多来自世界各国的优秀资深工程师和学者，将其多年的市场经验、学术研究和业界发展动向融入教学，实现企业需求与人才培养的紧密结合，培养国际化、实用化的软件工程技术人才和管理人才。
目前，学院有专兼职教师100多名，其中约45%的教师为外籍或在国外获得博士、硕士学位并可以原文讲课，约1/4的课程由原文讲授（英文或日文），85%以上的课程采用双语讲授。
本院现有学生1800余名，其中硕士研究生超过1200名。
　　软件学院力求突破传统学科体系设置，严格遵照“必须有巨大的市场需求、必须有领导性企业的支持合作、必须达到国内领先水平”原则，设立了日文应用软件开发、集成电路设计、信息工程监理、高级IT项目管理与营销、计算机游戏设计、软件质量与测试、软件工程与管理以及信息安全等八个专业方向。
其中日文应用软件开方向是教育部与中央电视台在北航众多专业中选择向社会推荐的两个专业之一，首批学生赴日实习就业率超过85%；集成电路设计方向率先与美国迈阿密佛罗里达州州立大学FIU合作办学，FIU教授来京全英文授课，学生可同时获得美国、中国认可的两个硕士学位。
　　为了真正培养出适合企业的实用型人才，也使企业与学院实现技术人才、产品研发等资源的最优共享，软件学院已与MICROSOFT、HP、ORACLE、CISCO、VIA、NEC、富士通、理光、用友、联想集团、恒基伟业、北京市软件出口基地等数百家国内外软件企业签订了合作协议，为学生提供了从培养定位、专业实践到面向就业的全过程支持。
2003级的学生中已有100多名被派往日本、加拿大、美国等海外软件企业实习就业，平均薪资远高于市场同类岗位薪资水平。
　　日文软件工程是目前国内唯一招收该领域本科生的专业方向。
经过软件学院日文软件工程本科专业教育的学生将具有扎实的基础、较宽的专业知识面、熟练的日语运用技能。
学院积极加强与200多家日文软件开发企业联盟之间的沟通与合作，共建日文软件工程实验室，提供全套日文软件开发环境支持、设立日文卫星语言教室，通过技术平台引入、技术专题讲座，使学生了解最新IT技术与工具，掌握成熟项目开发及管理经验，在来自日本的项目指导教师的协助下，按团队形式完成一定规模项目，得到实际应用训练，懂得日文软件开发规范和开发流程，能胜任能够从事日文软件工程领域的科研、开发及管理等工作。