制药工程专业大学本科，学制四年，授予工学学士学位。
培养目标培养具备药物制备、工程设计与生产的基本理论、基本知识和基本技能，具有创新精神和实践能力，具有能够在药物研究与开发单位、医药院校、医药流通、药政管理和制药企业及相关企业和部门从事药物的生产、工艺改进、研制开发、工程设计、教学研究、科学管理及技术服务等的制药工程专门人才。
主要课程有机化学、生物化学、物理化学、化工原理、制药工程、药物合成反应、药物化学、药理学、药剂学、天然药物化学、生物制药、制药工程学、化学制药与工艺学、药用高分子材料等。
专业特色本专业与福建师范大学生命科学院联合办学，重点依托两校的资源与优势，共同培养具有新药研发能力，掌握药品制造工程技术的人才，专业交叉性强，发展潜力大。
本专业人才能够适应国内化学药物合成、工艺设计与革新、新药研制与开发和工程设计等方面的科学研究工作，解决药品生产过程中的工程技术问题。
就业方向从事药物的生产、管理、科研开发等各类技术工作，也能在医药、农药、精细化工和生物化工等领域从事医药产品的生产、科技开发、应用研究、药厂设计和经营管理等方面的工作。