生物工程专业（四年制本科）培养目标：本专业培养具备生物技术及其产业化的科学原理、工艺技术过程和工程设计等基础理论和技能，能在生物技术与工程领域从事设计、生产、管理和新技术研究、新产品开发等方面工作的高级生物工程技术专门人才。
主要专业课程：化学、生物化学、微生物学、机械设计基础、生物分离技术、生物工程设备、酶工程、发酵工程、酿造工艺、基因工程、分子生物学等。
就业方向：本专业学生毕业后可在生物医药、生物化工、生物工程、食品生物技术、食品酿造、食品轻工、药检、海关、能源、环保等企事业单位、科研机构从事生物工程相关产品开发、工艺及设备的研究、监督管理及市场营销工作，亦可在相关院校和研究部门从事教学、科研等工作。
本专业按理科类招生。
毕业生符合条件者授予工学学士学位。
附：自2004年开始，我校食品科学与工程学院与加拿大马尼托巴大学农业食品与工程学院签订了2+2联合培养本科生项目。
应用化学、食品科学与工程、食品质量与安全、粮食工程、生物工程专业学生在我校修完前两年规定学分，平均学分绩点达到2.5以上，通过英语四级考试，即可申请该联合培养项目，申请成功后，在大二结束后的暑假即赴加拿大完成后两年学业，修完加方后两年规定学分后，可同时获得由马尼托巴大学和我校分别颁发的毕业证书及学位证书，毕业证和学位证与马尼托巴大学四年制在校学生无异。